Introdução: As infecções causadas por micobactérias oportunistas têm se tornado mais frequentemente relatadas. Um percentual significativo de indivíduos infectados com o HIV desenvolvem tuberculose (TB), enquanto outros desenvolvem infecções com outras micobacterias, como por exemplo, membros do complexo M. avium. Considerando que o tratamento para a TB é inócuo para as demais micobacterioses faz-se necessário a correta identificação do microrganismo envolvido. Objetivo: Identificar, através do sequenciamento de regiões variáveis do gene hsp65 a frequência de M. avium entre suspeitos de TB em um hospital no extremo sul do Brasil. Método: Foi realizado um estudo retrospectivo, entre 1º de janeiro à 31 de dezembro de 2015, envolvendo amostras de DNA, provenientes de isolados com características macro e microscópicas de micobactérias, obtidas de pacientes suspeitos de TB, encaminhadas ao Laboratório de Micobactérias do Hospital Dr. Miguel Riet Correa Jr., na cidade do Rio Grande – RS. Inicialmente foi realizada PCR, para detecção do elemento de inserção IS 6110, como ferramenta para identificar membros do complexo M. tuberculosis. Na ausência da inserção, foi realizada uma nova PCR, para detecção de um fragmento do gene hsp65 seguido do sequenciamento deste fragmento para identificação da espécie de micobactéria envolvida. Resultados: 30,4% (148/486) dos pacientes foram infectados com cepas identificadas como membros do complexo M. tuberculosis e 6,1% (30/486) como outros microrganismos. Entre estes isolados 43% (13/30) foram identificados como M. avium, seguido por Rhodococcus spp, Rothia mucilaginosa, Gordonia spp, Cryobacterium spp 3,3% (1/30) cada, Streptomyces spp 20% (6/30), Nocardia spp, Corynebacterium spp 6,6% (2/30) cada, e 3,3% (1/30) M. monacense. Interessantemente duas cepas caracterizadas como membros do gênero Mycobacterium, foram IS 6110 negativo e após o sequenciamento do hsp65 foram identificadas como membro do Complexo Mycobacterium tuberculosis. A correta identificação está em andamento através de outros biomarcadores. Dentre os pacientes dos quais foi isolado os microrganismos não pertencentes ao complexo M. tuberculosis, 50% (15/30) eram HIV positivos, sendo M. avium 46,6% (7/15), Rothia Mucilaginosa 6,6% (1/15), Cryobacterium spp 6,6% (1/15), Streptomyces spp 6,6% (1/15), Corynebacterium spp 6,6% (1/15), M. monacense 6,6% (1/15) e Complexo M. tuberculosis 20% (3/15). Considerações finais: A frequência de infecções com micobactérias
oportunistas é frequente em pacientes co-infectados com o HIV. Além disso, outros microrganismos BAAR também tem sido descritos como agentes etiológicos de infecções em imunodeprimidos. Este estudo mostrou um amplo espectro de microrganimos BAAR, inclusive alguns não pertencentes ao gênero Mycobacterium, indicando a necessidade de ampliar a acurácia do diagnóstico microbiológico, de forma a contribuir para a resolução da enfermidade.
Palavras-chave: Micobactérioses; Sequenciamento; HIV; Mycobacterium Avium.