Introdução: Ambientes como os de consultórios odontológicos possuem um grande fluxo de pessoas, incluindo pacientes, profissionais da saúde e demais funcionários, durante o dia todo, fazendo com que a disseminação de bactérias possa ocorrer muito facilmente nestes locais. Nota-se que pouca ênfase é dada a essas questões. O uso de EPI's, que é fundamental, é uma ferramenta bastante eficiente e utilizada com muito comprometimento pelos indivíduos envolvidos neste meio para a prevenção das contaminações. Porém, juntamente a isto, a esterilização e desinfecção dos materiais e meios utilizados devem ser levadas, também, como fator fundamental na higienização destes locais de trabalho, visto que grande parte dos micro-organismos existentes no consultório vem do meio externo, o que deve aumentar a preocupação quanto a esse problema. Diversos produtos possuem como finalidade a desinfecção, sendo que devem possuir registro junto ao MS e necessitam ser analisados em relação ao custo/benefício, à eficácia e ao artigo a ser processado. Objetivo: Isolar e identificar os micro-organismos antes e depois da desinfecção com três diferentes reagentes nas clínicas odontológicas da UNISC, no período de março a abril de 2013. Metodologia: Foi realizado um estudo descritivo-analítico transversal e de intervenção na clínica odontológica da UNISC. No estudo, foram analisados dois equipamentos odontológicos (superfície das mesas de apoio e refletor de luz) das clínicas odontológicas antes e depois da utilização dos desinfetantes (álcool 70%, peróxido, hipoclorito 5% e Incidin®). A coleta de material foi realizada com o uso de um "swab" estéril, umedecido em solução fisiológica a 0,89%. Em seguida o "swab" foi rolado 1cm² sobre a superfície do equipamento e colocado em 5 ml do caldo BHI (Brain Heart Infusion). Foram realizados testes em 20 bancadas diferentes para posterior análise de crescimento microbiano e eficácia de cada reagente. Resultados: Os reagentes de maior eficiência foram o Incidin® e o Hipoclorito de Sódio 5%: ambos os testes de desinfecção realizados com os dois produtos, apresentaram 100% de eficácia. Os testes com Peróxido de Hidrogênio apresentaram 90% de eficiência, enquanto o álcool 70% apresentou 50% de eficácia. Das 80 placas semeadas, os micro-organismos mais encontrados antes do uso dos desinfetantes foram Staphylococcus Coagulase Negativa (80%) Staphylococcus aureus (30%) e Corynebacterium sp. (20%). Em 24 amostras foi encontrado mais de um micro-organismo. No estudo, o Incidin® e o Hipoclorito de Sódio 5% apresentaram 100% de eficiência para desinfetar os micro-organismos presentes nos refletores de luz e as bancadas dos consultórios odontológicos da UNISC. Conclusão: Maiores estudos devem ser feitos em demais locais de saúde para conferir a eficácia dos desinfetantes sobre outros micro-organismos.