INTRODUÇÃO: A infecção pelo Papilomavírus Humano (HPV) é consideradaatualmente um problema de saúde publica devido a sua alta prevalência de contágio etransmissão, sendo de extrema importância a sua detecção o mais precoce possível,permitindo assim que ocorra uma maior eficácia do tratamento e evitando a invasão dolocal quando contaminado pelo vírus, sendo este desencadeador de lesões cévicovaginaise câncer de colo uterino. OBJETIVO: Este estudo tem como objetivo detectar ovírus do HPV através da técnica de Espectroscopia Infravermelho com Transformada deFourier (FT-IR) utilizado amostras de escovado cérvico-vaginal de mulheres querealizaram a coleta de papanicolau pelo Serviço Integrado de Saúde da Universidade deSanta Cruz do Sul no município de Santa Cruz do Sul. MÉTODOS: Foi realizado umestudo descritivo-analítico transversal no mês de março a agosto de 2017. O estudobaseou-se na coleta de dados clínicos epidemiológicos e análise das amostras cérvicovaginaisde 35 mulheres utilizando a técnica de FT-IR por estatística descritiva paraanálise univariada reconhecendo os padrões espectrais pelos algoritmos de Análise porComponente Principais (PCA) e por Modelagem Independente Flexível por Analogia deClasses (SIMCA) e como método ouro a técnica de PCR para presença do HPV,utilizando os primers consenso MY09/MY11 para a detecção do vírus. RESULTADOS:Com a utilização da técnica de FT-IR e otimização das distâncias das interclasses omodelo apresentou uma confiabilidade de acerto de 100%, sendo possível observaramostrar negativas e com suscetibilidade de ser positiva de acordo com as bandasespectrais, apresentando uma alta confiabilidade na validação da técnica