Eutrofização é um dos problemas de qualidade da água de maior importância na atualidade, que leva a proliferação acelerada de macrófitas aquáticas e algas que podem produzir substâncias tóxicas nocivas à saúde. Algal Turf Scrubber (ATS) é um sistema alternativo que utiliza o perifíton formando um biofilme para controlar uma grande variedade de parâmetros de qualidade da água. Diante disto, este trabalho tem como objetivo a biorremediação utilizando sistema piloto ATS™ instalado em um reservatório de água de abastecimento em Santa Cruz do Sul/RS. Também, buscou obter dados para verificar a potencialidade de uso da biomassa coletada. Para tanto na margem do lago foi construído uma unidade de ATS™ piloto, confeccionado em acrílico de 3 mm de espessura com sistema de bombeamento é realizado através de uma bomba d’água submersível. A vazão para o fornecimento de água superficial do reservatório é aproximadamente de 5 L/min com uma velocidade de 0,1 m/s. Após a instalação do ATS™, o perifíton se proliferou nos três canais da rampa e as coleta realizada a cada 14 dias e a biomassa é filtrada em tecido e seca em estufa com circulação de ar a 50°C até peso constante. Depois do biofilme seco é triturado em moinho de facas do tipo Willey e realizada a extração da fração lipídica pelo método de Bligh & Dyer. Em seguida, foi realizado a derivatização dos triacilgliceróis dos lipídios em ésteres metílicos para verificação da composição de ácido graxo por cromatografia gasosa com detector de massas (CG-EM). A análise de proteínas na biomassa foi realizada a partir do resultado de nitrogênio na analise elementar. Semanalmente são monitorados parâmetros como: alcalinidade total, COT, IC e TN, através de um analisador de carbono da marca Shimadzu TOC. Os resultados indicam que o sistema ATS™ foi construído em condições favoráveis para a formação do biofilme. O total de biomassa obtido para a primeira coleta foi de 275 gramas com teor lipídico de 7,06±1,64%, a segunda coleta foi obtida 179 gramas o que representou teor de 5,43± 0,46% e os principais ácidos graxos encontrados foram C14:0, C16:0, C18:1, C18:2 e C18:3, sendo que os ácidos graxos insaturados se destacaram nas duas coletas. Quanto ao teor de proteínas, apresenta uma média das duas coletas de 22,8±4,2%. As amostras de águas bruta apresentaram valores de alcalinidade na faixa de 21 a 32,5 mg/L de CaCO₃ , já as tratadas ficaram em torno de 16,9 a 30,5 mg/L de CaCO₃. Com relação aos resultados do COT, a maioria das amostras brutas apresentou uma concentração menor que as tratadas, este comportamento pode ser explicado devido à absorção do carbono orgânico pelas microalgas. Quanto ao carbono inorgânico quase todas as amostras brutas apresentaram valores superiores se comparadas às tratadas. Com os resultados encontrados no sistema ATS™ observa-se o sucesso na formação do perifíton em forma de um biofilme. Esta biomassa apresenta uma composição lipídica 4,1%, não sendo o principal constituinte da biomassa. O biofilme gerado pode ser de interesse comercial, agregando valor econômico ao processo de tecnologia ambiental.