Obesidade é uma desordem multifatorial que está associada com doenças como diabetes mellitus tipo 2 e doenças cardiovasculares. Nos últimos anos ela atingiu proporções epidêmicas ao redor do mudo. Mudanças nos fatores ambientais como maior disponibilidade de alimentos com alto teor calórico, marketing alimentício e diminuição do gasto calórico são determinantes para a obesidade ter alcançado esse status. Além dos fatores ambientais, a genética também contribui para o desenvolvimento da obesidade. Polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) nos genes ADIPOQ, FNDC5 e TMEM18 e as concentrações séricas das proteínas adiponectina e irisina, podem estar associadas à parâmetros ligados a obesidade. Neste sentido, o objetivo do presente estudo foi investigar se os SNP’s nos genes ADIPOQ rs182052, FNDC5 rs16835198, TMEM18 rs6548238 e os níveis plasmáticos das proteínas adiponectina e irisina estão associados com parâmetros bioquímicos e antropométricos em crianças e adolescentes. Participaram da pesquisa 400 escolares, com idades entre 7 e 17 anos, provenientes de escolas da rede pública e privada de Santa Cruz do Sul/RS. Para a genotipagem, foi extraído DNA pelo método de Salting out e em seguida realizou-se reação de qPCR no aparelho StepOne Plus® (Applied Biosystems, Foster City, CA, EUA). Além das variáveis genéticas, verificou-se sexo, faixa etária, etnia/cor, Índice de Massa Corporal (IMC), Circunferência da Cintura (CC), Percentual de Gordura (%G), variáveis bioquímicas como Colesterol Total (CT), Colesterol LDL (c-LDL), Colesterol HDL (c-HDL), Triacilgliceróis (TAG), Glicose, além da Pressão Arterial Sistólica (PAS) e Pressão Arterial Diastólica (PAD). A mensuração sérica das proteínas adiponectina e irisina foram realizados através do ensaio imunoenzimático (ELISA). Os dados foram analisados no programa estatístico SPSS v.20, por estatística descritiva, além de serem testados o equilíbrio de Hardy-Weinberg (HWE) e a normalidade por Kolmogorov-Smirnov. Foram utilizados os testes de ANOVA e Mann-Whitney. As análises mostraram que o SNP rs182052 no gene ADIPOQ esteve associado com maiores valores de IMC (p=0,043), CC (p=0,035), HDL (p=0,049), LDL (p=0,010) e CT (p=0,002). O SNP rs6548238 no gene TMEM18 esteve associado com maiores médias de IMC (p=0,047), LDL (p=0,017) e CT (p=0,003). O SNP rs16835198 no gene FNCD5 e as concentrações séricas de irisina não estiveram associadas com os parâmetros analisados, entretanto, os níveis de adiponectina foram relacionados com concentrações de triglicerídeos nos escolares (p= <0,036).  A presença dos polimorfismos rs182052 no gene ADIPOQ e rs6548238 no gene TMEM18, estiveram associados com parâmetros de adiposidade e bioquímicos. Já as concentrações séricas da adiponectina demonstraram relação com triglicerídeos nos escolares.