O desenvolvimento de novas biotecnologias associados a qualidade espermática é um dos grandes avanços na área da andrologia e fertilidade. O uso de marcadores moleculares na identificação de ejaculados são promissores para estudos da saúde reprodutiva animal e humana. Recentemente identificou-se maior presença das proteínas Calreticulina (CALR) e Lipocalina epidídimo-específica (LCN5) em espermatozoides de suínos com degeneração testicular e deficiência androgênica induzidos pelo bloqueio do hormônio liberador de gonadotrofinas (GnRH), efeito que leva a consequente deleção de testosterona sérica. Sabe-se que estas proteínas estão associadas a qualidade espermática, no entanto sua regulação endócrina ainda não foi descrita. O objetivo do nosso trabalho foi verificar se a imunocastração por bloqueio do GnRH altera a expressão dos genes CALR e LCN5 no testículo e diferentes regiões epididimárias comparando animais sadios e animais com deficiência androgênica. Para isto, foram utilizados amostras de tecidos reprodutivos de suínos machos púberes castrados cirurgicamente (grupo controle, n=8), e tecidos reprodutivos de suínos machos púberes imunocastrados com a vacina Vivax (Pfzer) (grupo tratamento, n=11), abatidos após dois meses de aplicação da vacina. As amostras foram coletadas no momento do abate ou castração e transportadas para o laboratório de Biotecnologia da UNIVATES em caixas refrigeradas. O RNA total das amostras foram obtidos através de 100mg do parênquima testicular, e três regiões do epidídimo: cabeça, corpo e cauda. Após, foram realizadas as bibliotecas de cDNA (síntese de DNA complementar) das amostras coletadas, e realizados a quantificação pela expressão gênica relativa da Reação em Cadeia da Polimerase (qPCR) utilizando-se a sonda SYBR Green para quantificação em aparelho StepOne Applied Biosystems. Foi observado que os animais com deficiência androgênica não apresentaram níveis diferentes de expressão de CALR nos tecidos avaliados em comparação com o grupo controle. Contudo, observou-se que a expressão do gene é maior nas regiões da cabeça e corpo do epidídimo em ambos os grupos experimentais. Diferentemente, a imunocastração reduziu a expressão da LCN5 no corpo e na cauda do epidídimo. Observou-se ainda que, em ambos os grupos, a cabeça é a região com maior expressão da LCN5. Conclui-se que a deficiência androgênica induzida por imunização contra o GnRH influencia a expressão da LCN5 no epidídimo mas não no testículo. Diferentemente, este efeito não foi observado para CALR.